无菌小鼠是袭取咫尺的监测按序在小鼠体内无法检测到任何微生物（包括细菌白丝 足交，真菌，病毒和寄生虫等除内源性逆转录病毒外）存在的一种小鼠。为了谛视任何微生物的可能沾污，无菌小鼠的饲养与无菌情状的督察必须按照严格的无菌饲养操作款式和严谨的样品检测要求进行，何况必须在严格监控的断绝器条目下操作扩充。
与惯例现实室小鼠比较，无菌小鼠的外不雅没什么很是的，然则其机能、结构和惯例现实室小鼠有一些不同，主要体当今以下几个方面：
肠谈结构
对无菌小鼠进行剖解，能不雅察到最彰着脾气是盲肠比平日小鼠大5-6倍。
图1. GF、SPF级BALB/c小鼠盲肠对比
不雅察其肠谈肌层，会发现它的肠谈肌层很薄、肠绒毛较不规章、绒毛长度相对较长，这是由于肠谈微生物等闲参与食品的代谢和招揽，无菌鼠因肠谈中缺失微生物群养分代谢破裂，发扬为结直肠和盲肠通过代偿性增生增多养分的招揽，其中增生进度以盲肠发扬最为彰着。
图2. 3月龄GF、SPF级 BALB/c 小鼠小肠组织结构图白丝 足交
肠谈机能
肠蠕动较慢、小肠通透性较低、肠上皮细胞再生才调较弱。
无菌鼠的轮回系统、血液系统和网状内皮系统
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和平日小鼠比较，无菌鼠的腹黑以及血容量相对较小、血液中的白细胞数增多且相对恒定、胆固醇含量增多。
脾脏缩小，无三级滤泡，网状内皮细胞功能裁减。这是由于无菌鼠中肠谈微生物群的缺失会严重影响肠谈关联免疫组织和淋巴细胞的发育，并导致先天性免疫搪塞收缩。
图3. GF、SPF级BALB/c小鼠脾脏对比
图4. GF、SPF级BALB/c小鼠肠系膜淋奉承组织结构图
疾病模子
时常对高脂饮食引起的肥壮不敏锐；
某些肿瘤易感小鼠（如某些基因修饰小鼠）经无菌化后，成为肿瘤不易感小鼠。
对饲养条目要求高
因为无菌鼠一直生涯在无菌的环境，它们对微生物的感染荒谬敏锐，也更容易出现沾污，因此白丝 足交对饲养繁衍的要求就更高。无菌动物体内不成合成维生素B和维生素K，需零星提供。无菌条目对动物生殖影响不大。无菌鼠因降生无感染，身体较好，其繁衍率高于平日大小鼠。
由于无菌鼠具有以上特殊的生理脾气，因此，在期骗无菌鼠模子时应试虑到这些可能影响现实效果的身分